Dabei hat CPSR auch das Anliegen, die Öffentlichkeit auf Entwicklungen im technologischen Bereich aufmerksam zu machen, die negative Auswirkungen auf die Gesellschaft haben könnten. Deshalb hat sich die Organisation auch eingehend mit dem Clipper-Chip beschäftigt und ist zu einem der Wortführer der Clipper-Gegner in der Diskussion geworden.
Unter der CPSR-Homepage findet man daher auch eine spezielle Clipper-Chip-Seite, die Links auf eine Reihe von verschiedenen Dokumenten über dieses Thema enthält. Das Spektrum dieser Texte reicht von offiziellen Verlautbarungen amerikanischer Regierungsstellen über eine Reihe von technischen Beschreibungen bis zu Protestbriefen und Memoranden gegen die Einführung des Chips.
Als die US-Regierung am 16. April 1993 ihre Clipper-Chip-Initiative bekanntgab, veröffentlichte CPSR noch am selben Tag einen Aufruf zur öffentlichen Diskussion über den Zweck des Chips, seine Auswirkungen auf Gesellschaft und Bürgerrechte und die fragwürdige Rolle der NSA in dieser Angelegenheit.
CPSR organisierte am 24. Januar 1994 einen von mehr als 40 Kryptographie- und Computer-Experten unterzeichneten offenen Brief an Präsident Clinton, in dem die Regierung dazu aufgefordert wird, die Pläne zur Einführung des Clipper-Chips fallenzulassen. Eine kurz darauf ebenfalls von CPSR in die Wege geleitete elektronische Petition gegen den Chip wurde von über 50000 Personen "unterzeichnet".
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